Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3BP20337 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB3BP20337 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms