Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAM1P18669 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGAM1P18669 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGAM1P18669 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAM1P18669 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGAM1P18669 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGAM1P18669 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGAM1P18669 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGAM1P18669 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGAM1P18669 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGAM1P18669 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGAM1P18669 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms