Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RAP15509 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms