Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPBP07199 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPBP07199 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPBP07199 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPBP07199 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms