Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH4O75427 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH4O75427 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms