Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT7O43581 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT7O43581 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT7O43581 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYT7O43581 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT7O43581 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT7O43581 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms