Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRGMA1A4Y4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms