Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms