Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 522.2■■□□□ 1.145e-9■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GGA2-202ENST00000562117 387 ntTSL 513.03□□□□□ -0.325e-9■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PPFIBP2-222ENST00000532416 538 ntTSL 411□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.413e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.093e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBBP7-207ENST00000444437 763 ntTSL 36.7□□□□□ -1.343e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EIF4G2-229ENST00000534272 591 ntTSL 34□□□□□ -1.778e-16■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.236e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.236e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 516.02■□□□□ 0.162e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-211ENST00000560247 1708 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.544e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-202ENST00000540594 1267 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-217ENST00000561371 555 ntTSL 411.63□□□□□ -0.554e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-216ENST00000561270 884 ntTSL 25.37□□□□□ -1.554e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KATNBL1-209ENST00000559760 733 ntTSL 54.24□□□□□ -1.734e-14■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 212.7□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 310.27□□□□□ -0.774e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HPN-209ENST00000600675 551 ntTSL 421.36■■□□□ 1.016e-9■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.216e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.756e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-209ENST00000428279 1525 ntTSL 510.71□□□□□ -0.696e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.036e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.556e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.686e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 521.41■■□□□ 1.028e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.98e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.28e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHAG-201ENST00000229810 1283 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.666e-16■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.836e-16■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.016e-16■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 USP15-205ENST00000546694 799 ntTSL 54.23□□□□□ -1.732e-37■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 USP15-219ENST00000552997 533 ntTSL 42.4□□□□□ -2.032e-37■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 316.29■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MPP1-217ENST00000493871 585 ntTSL 27.76□□□□□ -1.171e-17■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.693e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.472e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.462e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 523.82■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 323.82■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.382e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ACO2-204ENST00000471094 699 ntTSL 321.54■■□□□ 1.043e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-207ENST00000485869 583 ntTSL 220.43■□□□□ 0.863e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 220.13■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-203ENST00000465629 2108 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.813e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 319.36■□□□□ 0.697e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 419.36■□□□□ 0.697e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COL9A3-205ENST00000466192 2194 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TST-203ENST00000438203 451 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.457e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 317.49■□□□□ 0.393e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.41■□□□□ 0.383e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COL9A3-214ENST00000490398 496 ntTSL 417.3■□□□□ 0.363e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 417.16■□□□□ 0.347e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ACO2-207ENST00000482208 624 ntTSL 317.07■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGPAT5-204ENST00000523586 468 ntTSL 416.96■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COL9A3-212ENST00000481800 548 ntTSL 416.6■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-211ENST00000533653 568 ntTSL 215.83■□□□□ 0.127e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.17e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNMT1-221ENST00000589538 559 ntTSL 515.69■□□□□ 0.13e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNMT1-229ENST00000593049 534 ntTSL 415.69■□□□□ 0.13e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.63■□□□□ 0.093e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KRT8-207ENST00000546921 542 ntTSL 415.56■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MYH10-206ENST00000465458 799 ntTSL 215.13■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-209ENST00000486825 850 ntTSL 514.68□□□□□ -0.064e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COL9A3-209ENST00000469852 901 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KRT8-212ENST00000549198 592 ntTSL 214.5□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM51-206ENST00000451326 766 ntTSL 314.47□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.5
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