Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 27.17□□□□□ -1.267e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-221ENST00000557491 2724 ntTSL 26.84□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FLVCR1-203ENST00000474693 590 ntTSL 36.83□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-212ENST00000518484 546 ntTSL 46.74□□□□□ -1.337e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.347e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.373e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZCCHC8-209ENST00000546149 657 ntTSL 36.48□□□□□ -1.377e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-219ENST00000620039 3428 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.447e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.487e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-208ENST00000554020 1193 ntTSL 55.75□□□□□ -1.493e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-216ENST00000556000 2092 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.553e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-201ENST00000367179 697 ntTSL 35.31□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RSRC2-206ENST00000525332 516 ntTSL 35.21□□□□□ -1.583e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NUF2-207ENST00000497990 885 ntTSL 55.15□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-207ENST00000465835 3172 ntTSL 54.91□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-204ENST00000589774 552 ntTSL 44.53□□□□□ -1.687e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ELP2-206ENST00000535093 582 ntTSL 44.34□□□□□ -1.713e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-210ENST00000593014 577 ntTSL 44.23□□□□□ -1.737e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.743e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SMCHD1-204ENST00000581226 459 ntTSL 33.9□□□□□ -1.793e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.83e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-212ENST00000555792 577 ntTSL 33.42□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FLVCR1-205ENST00000579295 479 ntTSL 33.23□□□□□ -1.893e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MAP4K3-207ENST00000465701 201 ntTSL 53.11□□□□□ -1.913e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-204ENST00000438366 545 ntTSL 33.05□□□□□ -1.923e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-214ENST00000555851 502 ntTSL 52.84□□□□□ -1.953e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KPNA2-206ENST00000583392 507 ntTSL 22.75□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-209ENST00000505588 212 ntTSL 52.66□□□□□ -1.983e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-212ENST00000482595 484 ntTSL 52.53□□□□□ -23e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KCTD9-210ENST00000523294 500 ntTSL 52.53□□□□□ -23e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CD164-206ENST00000499860 2845 ntTSL 1 (best)2.24□□□□□ -2.053e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MAP4K3-213ENST00000497566 528 ntTSL 32□□□□□ -2.093e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RAB17-207ENST00000416106 587 ntTSL 313.78□□□□□ -0.22e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ITIH3-205ENST00000465243 824 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-22■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ITIH3-203ENST00000463893 529 ntTSL 47.68□□□□□ -1.182e-22■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ELL2-203ENST00000506628 520 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 318.81■□□□□ 0.61e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.518e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-25■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ARFGAP1-207ENST00000518618 1244 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-25■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 59.06□□□□□ -0.963e-13■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 325.24■■□□□ 1.632e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 TFRC-206ENST00000463047 549 ntTSL 24.48□□□□□ -1.697e-9■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-20■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-208ENST00000510195 445 ntTSL 224.89■■□□□ 1.581e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.451e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-213ENST00000514929 775 ntTSL 523.12■■□□□ 1.291e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-217ENST00000576353 700 ntTSL 522.43■■□□□ 1.181e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 521.94■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-204ENST00000418005 563 ntTSL 421.63■■□□□ 1.051e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-209ENST00000510558 1051 ntTSL 521.59■■□□□ 1.051e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-216ENST00000573795 583 ntTSL 520.34■□□□□ 0.851e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-205ENST00000522595 1114 ntTSL 219.93■□□□□ 0.786e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 KALRN-209ENST00000454902 722 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGHMBP2-204ENST00000539064 2346 ntTSL 219.23■□□□□ 0.671e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-203ENST00000480132 496 ntTSL 417.5■□□□□ 0.396e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.26e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-C8orf76-202ENST00000622816 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.08■□□□□ 0.166e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-210ENST00000620634 885 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGHMBP2-203ENST00000537458 813 ntTSL 315.81■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-208ENST00000464301 571 ntTSL 415.2■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-205ENST00000507302 742 ntTSL 315.13■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGHMBP2-206ENST00000541229 549 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 PRR14L-202ENST00000330495 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.08■□□□□ 01e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 MKS1-211ENST00000581761 812 ntTSL 314.98□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-207ENST00000524267 614 ntTSL 414.71□□□□□ -0.056e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-212ENST00000466121 522 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-212ENST00000514089 571 ntTSL 514.09□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IFT172-215ENST00000494163 607 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF564-204ENST00000465410 514 ntTSL 513.88□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-206ENST00000415068 543 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-206ENST00000475078 490 ntTSL 413.39□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 DHRS1-211ENST00000561281 1181 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IFT172-212ENST00000479419 420 ntTSL 313.3□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-204ENST00000472351 791 ntTSL 413.29□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGHMBP2-207ENST00000543739 2846 ntTSL 213.17□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-206ENST00000509989 677 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 PRR14L-207ENST00000492705 548 ntTSL 212.93□□□□□ -0.341e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF564-205ENST00000596193 524 ntTSL 412.78□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF564-203ENST00000427105 575 ntTSL 412.57□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 LTBR-203ENST00000441074 2327 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-204ENST00000412947 595 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 10.6
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