Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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