Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GY05 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GY05 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GY05 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V9GY05 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GY05 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GY05 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GY05 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GY05 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GY05 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GY05 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GY05 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GY05 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GY05 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GY05 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms