Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM50BQ9Y247 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms