Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP3Q9Y228 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms