Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms