Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS11EQ9UL52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms