Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACL1Q9UJ83 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACL1Q9UJ83 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms