Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN4Q9UHM6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms