Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms