Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms