Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP35Q9P2H5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP35Q9P2H5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
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