Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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