Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCFC1R1Q9NWW0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms