Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX15Q9NRS6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX15Q9NRS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms