Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AKIP1Q9NQ31 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AKIP1Q9NQ31 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms