Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC4Q9NPP4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC4Q9NPP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms