Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC17Q9NP64 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms