Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4AQ9H788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4AQ9H788 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms