Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1DQ9H5J8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1DQ9H5J8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms