Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms