Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR12Q9C0I1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTMR12Q9C0I1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms