Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms