Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA3Q9BTC8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTA3Q9BTC8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms