Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRADC1Q9BSG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms