Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED1Q99966 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms