Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA3Q99618 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms