Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms