Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NSMCE2Q96MF7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms