Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC4Q96FT7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC4Q96FT7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC4Q96FT7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms