Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STAMBPL1Q96FJ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms