Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC97Q96F63 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms