Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC39Q96DD0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms