Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN3Q969G5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms