Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC57Q8N9N7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms