Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT20Q8IY31 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT20Q8IY31 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT20Q8IY31 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT20Q8IY31 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms