Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM228AQ86W67 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM228AQ86W67 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms