Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP31Q70CQ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
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