Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms