Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms