Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CSAG1Q6PB30 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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CSAG1Q6PB30 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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